¿Windows Vista? Yo borraba todo directamente. XD
Si no recuerdo mal había una serie de virus que se autoreplicaban ellos mismos o que copiaban indiscriminadamente un archivo del disco duro en cuestion con la intención de saturar el disco duro.
buscate algun software (yo usaba el TuneUp utilities) para ver en que carpetas tienes mucha (mas de la que debiera) informacion, asi los puedes borrar a mano.Revisa el inicio, el registro, etc.Zalu2