¿A qué te refieres con restaurar el sistema? Si hablas de la opción de Windows de volver hacia atras, dejame decirte que eso no borrará archivos del usuario y por ende tu troyano seguirá en su lugar.
no elimina todo lo que hay nuevo en el pc seria un caos en caso de tener documentos nuevos, restaura a partir de un backup hecho cada cierto tiempo o manualmente, restaura una configuracion hecha en el sistema solo modifica archivos del sistema, por lo tanto quiza un server pero si esta en modo persistente dentro de otra carpeta fuera de windows o archivos de programas se quedara creo
Ahora me dejais con la duda.... Eso lo probare haber que pasa ... aajaja